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Affymetrix芯片服務平臺

Affymetrix GeneChip生物芯片檢測系統, 是由高密度GeneChip芯片和試劑, 雜交、掃描儀器,數據處理和分析工具組成的一整套檢測平臺, 是世界上第一種經歐盟和美國FDA審批的可用作體外診斷的芯片系統。

Affymetrix芯片技術特點:

Affymetrix 芯片服務平臺一覽:

 

一、基因組層次研究服務: 

 Affymetrix SNP分型芯片服務

芯片名稱

芯片信息

Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0

該芯片涵蓋超過1,800,000個遺傳變異標志物:包括超過906,600個SNP和超過946,000個用于檢測拷貝數變化(CNV,Copy Number Variation)的探針

Affymetrix Mouse Diversity Genotyping Array

這款芯片與Human SNP 6.0 芯片類似,既包含SNP探針,也包含CNV探針。一共涵蓋623,124個SNP位點和916,269個CNV探針。

Affymetrix GeneChip Rice 44K SNP Genotyping Array

芯片覆蓋indica, aus, tropical japonica, temperate japonica, and group V (“aromatic”)多個水稻亞種的44,1000個SNP。 每10kb至少包括1個SNP,每個SNP設計12個探針技術重復相關系數R2 > 99%。

二、轉錄組層次研究服務: 

 Affymetrix基因表達譜芯片服務

芯片名稱

芯片信息

Affymetrix GeneChip® Human Genome U133 Plus 2.0 Array

該芯片包含了47,000個轉錄本,代表了38,500個明晰的人類基因。數據庫來源于GeneBank、dbEST、RefSeq、UniGene database、Washington University EST trace repository、NCBI human genome assembly。

Affymetrix GeneChip Human Transcriptome Array 2.0

最高分辨率的基因芯片,支持所有轉錄本異構體的全轉錄組分析,包含超過六百萬條不同探針,覆蓋編碼和非編碼轉錄本。

該芯片為每個外顯子設計約10條探針,每個外顯子之間的剪接點有4條探針,確保每個實驗都能獲得完整、準確和可重復的數據。重復性高(批內相關系數≥0.99),所有檢測過的組織觀察到的變異系數(CV)<6.5%。樣品類型既包括新鮮凍存樣品,也包括FFPE 樣本。

Affymetrix GeneChip Human Gene 2.0ST Array

Affymetrix新一代全轉錄本芯片,在一張芯片上可以同時檢測mRNA和lincRNA, 與上一代1.0 ST Array相比,2.0 ST Array有更多的優點:全面覆蓋轉錄組,可以同時檢測>30,000個編碼的轉錄本和>11,000個長鏈非編碼轉錄本;探針設計最大程度覆蓋所有外顯子,可檢測選擇性拼接/轉錄本變體。每個轉錄本覆蓋特異探針的數目中值達到21種,每種探針的長度為25bp,這意味著每個轉錄本將被檢測的堿基數中值高達525個;重復性高;靈敏度高。

Affymetrix GeneChip Mouse Gene 2.0 ST Array(

Affymetrix新一代全轉錄本芯片,在一張芯片上可以同時檢測mRNA和lincRNA, 與上一代1.0 ST Array相比,2.0 ST Array有更多的優點:全面覆蓋轉錄組,可以同時檢測35,240個編碼的轉錄本和>2,000個lincRNA;探針設計最大程度覆蓋所有外顯子;重復性高;靈敏度高。

Affymetrix GeneChip Mouse Genome 430 2.0 Array

該芯片涵蓋了39,000個轉錄本,代表34,000個明晰的小鼠基因。序列信息基于GeneBank、dbEST、RefSeq、UniGene database。 

Affymetrix GeneChip Rat Genome 230 2.0 Array

該芯片包含有31,000個probe sets,代表28,000個明晰的大鼠基因。序列信息基于GenBank , dbEST, RefSeq等權威數據庫。 

 Affymetrix miRNA芯片服務

芯片名稱

芯片信息

Affymetrix miRNA 4.0 Arrary

100% 覆蓋miRBase v20數據庫,同時檢測203個物種的miRNA,信息量大-芯片結果包括:host gene ID、miRNA target genes、clustered miRNA等

Affymetrix miRNA 3.0 Arrary

含蓋Sanger miRBase V17.0數據庫,同時檢測153個物種的miRNA,同時檢測成熟miRNA和miRNA前體,能檢測人snoRNA和scaRNA

技術支持

電話:021-57072092
Email:service6@sangon.com

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